Submitted by vloux on Thu, 01/20/2022 - 18:57

Bonjour,

(english below)

Il reste encore quelques jours pour vous souhaiter à toutes et tous une très bonne année 2022

La crise sanitaire a de nouveau impacté nos activités mais nous avons su en 2021, comme l’année précédente, adapter notre offre de service aux contraintes. Nous avons pu, par exemple, maintenir l’ensemble des modules du cycle de formation 2021, en en basculant certains à distance.

Au delà des contraintes persistantes et d’un espoir de retour rapide à la normale, 2022 s’annonce comme une année riche pour Migale. Nous vous en détaillons quelques éléments dans les lignes suivantes, mais vous invitons tout d’abord à prendre quelques minutes pour répondre à notre enquête de satisfaction annuelle. Cette enquête dont vous avez maintenant l’habitude nous aide à orienter les futurs développements de la plateforme. Merci de prendre quelques minutes pour y répondre.

Après deux ans passés à nos cotés, Damien Berry quitte la plateforme pour aller travailler à l’INU Champollion à Albi. Damien a accompagné Migale dans son développement et dans le renouvellement de son infrastructure. Il travaillera encore deux jours par semaine dans l’équipe jusqu’à fin février 2022. Merci à Damien pour le travail effectué, nous lui souhaitons beaucoup de succès dans ses nouvelles fonctions. Nous espérons l’ouverture d’un poste d’administrateur système très prochainement pour remplacer Damien  et avons le plein soutien de nos départements MICA et MathNum. 

Christelle Hennequet-Antier, Ingénieure de Recherche en biostatistique, rejoindra l’équipe à partir du 1er février pour renforcer le service d’analyse. Nous profiterons d’une prochaine nouvelle sur le site pour présenter Christelle, ses compétences et son parcours.

 

Le cycle de formation à la bioinformatique par la pratique 2022 a été ouvert la semaine dernière.  Pour prendre en compte les contraintes sanitaires actuelles, les premiers modules du cycle sont d’ores et déjà prévus à distance. Cette année, en plus des modules existants, deux nouveaux modules vous sont proposés : « Introduction au Text Mining avec AlvisNLP », « Bonnes pratiques pour une meilleure reproductibilité des analyses bioinformatiques ».

Nous vous rappelons également qu’en complément de nos formations, nous mettons régulièrement à disposition des tutoriels sur notre site web. En 2021 deux nouveaux tutoriels ont été publiés : « Metabarcoding analysis (16S rRNA marker) with FROGS » et « Initiation à R ».

 

Côté infrastructure, nous allons faire évoluer notre équipement ces prochaines semaines : changement de système d’exploitation, renouvellement d’une partie de notre cluster de calcul et extension de notre stockage sont en cours. Ce chantier ainsi que son planning vous sera présenté plus en détail dans une très prochaine nouvelle.

Nous vous souhaitons à nouveau une très belle année 2022.

Bonnes analyses,

L’équipe Migale

 

 

Hello to all Migale users,

There are still a few days left to wish you all a happy new year 2022

The health crisis has again impacted our activities in 2021 but we have been able to adapt our service offer to the constraints, as we did the previous year. For example, we were able to maintain all the modules of the 2021 training cycle, switching some of them to distance learning.

Beyond the persistent constraints and the hope of a quick return to normal, 2022 promises to be a rich year for Migale. We will detail a few elements in the following lines, but first, we invite you to take a few minutes to answer our annual satisfaction survey (in french). This survey, which you are now accustomed to, helps us to guide the future development of the platform. Thank you for taking a few minutes to complete it.

After two years with us, Damien Berry is leaving the platform to work at INU Champollion in Albi. Damien has accompanied Migale in its development and in the renewal of its infrastructure. He will still work two days a week in the team until the end of February 2022. We thank Damien for his work, we wish him a lot of success in his new position. We hope to have an opening for a system administrator position very soon to replace Damien and have the full support of our MICA and MathNum departments on this point. 

Christelle Hennequet-Antier, Research Engineer in biostatistics, will join the team from February 1st to reinforce the analysis team. We will take advantage of a future news on the website to present Christelle, her skills and her background.

The 2022 bioinformatics training cycle was opened last week. In order to take into account the current sanitary constraints, the first modules of the cycle are already planned to be delivered at a distance. This year, in addition to the existing modules, two new modules are proposed: "Introduction to Text Mining with AlvisNLP", "Good practices for a better reproducibility of bioinformatics analyses".

We also remind you that in addition to our training courses, we regularly provide tutorials on our website. In 2021 two new tutorials have been published: "Metabarcoding analysis (16S rRNA marker) with FROGS" and "Initiation to R" (in french).

 

On the infrastructure side, we are going to upgrade our equipment in the next weeks: change of operating system, renewal of a part of our computing cluster and extension of our storage are in progress. This project and its planning will be presented to you in more detail in a future news.

We wish you again a very nice year 2022 and successful analysis on Migale,

The Migale team

 

 

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