Chères et chers collègues,
Nous avons le plaisir de vous proposer une nouvelle rencontre en ligne « Migale & vous » pour échanger autour des activités de la plateforme. Ces rencontres régulières sont destinées aux utilisateurs de la plateforme intéressés pour (re-)découvrir ou discuter autour des offres de service de la plateforme.
Pour cette 4ème édition, nous accueillerons Nuria Mach (INRAE, ENVT, UMR 1225).
Migalez-vous le jeudi 27 mars 2025 de 14h à 15h00 via https://inrae-fr.zoom.us/j/99638825150
Titre : "Symphonie du Microbiome : Intégration des Multi-Omics pour Combattre les Infections Respiratoires chez les Veaux"
Résumé :
Le complexe respiratoire bovin revêt une importance majeure en France et dans le monde en raison de son impact sur la santé et le bien-être des animaux, ainsi que des pertes économiques qu’il entraîne. Les agents étiologiques responsables de cette maladie sont principalement des bactéries et des virus qui agissent de manière synergique. Chez un animal sain, la couche de mucus des voies respiratoires sert de barrière physique. Elle contient des mucines et un écosystème microbien riche en taxons qui contribuent à empêcher l'entrée et à favoriser l'élimination des pathogènes. Ces pathogènes utilisent fréquemment les glycanes des cellules eucaryotes et des mucines (appelés « glycome ») pour accéder à l'hôte. Dans ce contexte, l’objectif de ce projet est de mieux comprendre l'interaction entre le microbiome, le glycome des mucines, et les pathogènes. Pour ce faire, nous avons créé Symphonie, qui regroupe 4 projets complémentaires, financés au niveau national et international, impliquant 8 unités INRAE, dont MaiAGE, et 7 institutions européennes internationales.
Dans le cadre de Symphonie, nous avons suivi longitudinalement 28 veaux, dont la moitié sont infectés expérimentalement par trois principaux pathogènes respiratoires : le virus de l'influenza D (IDV), le coronavirus bovin (BCoV) et une bactérie pathogène, Mycoplasma bovis. Au cours de l’infection, nous avons produit des données métagénomiques des voies respiratoires et digestives, des données de microbiote 16S, des données cliniques, hématologiques, métaboliques, transcriptomiques, metabolomiques, glycomiques, des observations comportementales, ainsi que des données continues provenant de podomètres, accéléromètres, thermobolus et microphones pour enregistrer les symptômes respiratoires. Pour chaque type de données, nous avons collecté 224 échantillons. Les données histologiques et phytopathologiques issues des nécropsies seront également intégrées pour fournir une compréhension complète des mécanismes sous-jacents. Nous utiliserons diverses méthodes statistiques pour intégrer et analyser ces données et comprendre comment la composition et la fonction du microbiote, en combinaison avec le profil glycomique des mucines et la physiopathologie de l'hôte, jouent un rôle dans la prévention et le contrôle des infections pathogènes. L'objectif final est de trouver une combinaison de bactéries ou de glycanes qui pourrait jouer un rôle en tant que probiotiques et prébiotiques.
Ensuite, un temps d'échange sera proposé avec les membres de la plateforme.
Nous avons le plaisir de vous proposer une nouvelle rencontre en ligne « Migale & vous » pour échanger autour des activités de la plateforme. Ces rencontres régulières sont destinées aux utilisateurs de la plateforme intéressés pour (re-)découvrir ou discuter autour des offres de service de la plateforme.
Pour cette 4ème édition, nous accueillerons Nuria Mach (INRAE, ENVT, UMR 1225).
Migalez-vous le jeudi 27 mars 2025 de 14h à 15h00 via https://inrae-fr.zoom.us/j/99638825150
Titre : "Symphonie du Microbiome : Intégration des Multi-Omics pour Combattre les Infections Respiratoires chez les Veaux"
Résumé :
Le complexe respiratoire bovin revêt une importance majeure en France et dans le monde en raison de son impact sur la santé et le bien-être des animaux, ainsi que des pertes économiques qu’il entraîne. Les agents étiologiques responsables de cette maladie sont principalement des bactéries et des virus qui agissent de manière synergique. Chez un animal sain, la couche de mucus des voies respiratoires sert de barrière physique. Elle contient des mucines et un écosystème microbien riche en taxons qui contribuent à empêcher l'entrée et à favoriser l'élimination des pathogènes. Ces pathogènes utilisent fréquemment les glycanes des cellules eucaryotes et des mucines (appelés « glycome ») pour accéder à l'hôte. Dans ce contexte, l’objectif de ce projet est de mieux comprendre l'interaction entre le microbiome, le glycome des mucines, et les pathogènes. Pour ce faire, nous avons créé Symphonie, qui regroupe 4 projets complémentaires, financés au niveau national et international, impliquant 8 unités INRAE, dont MaiAGE, et 7 institutions européennes internationales.
Dans le cadre de Symphonie, nous avons suivi longitudinalement 28 veaux, dont la moitié sont infectés expérimentalement par trois principaux pathogènes respiratoires : le virus de l'influenza D (IDV), le coronavirus bovin (BCoV) et une bactérie pathogène, Mycoplasma bovis. Au cours de l’infection, nous avons produit des données métagénomiques des voies respiratoires et digestives, des données de microbiote 16S, des données cliniques, hématologiques, métaboliques, transcriptomiques, metabolomiques, glycomiques, des observations comportementales, ainsi que des données continues provenant de podomètres, accéléromètres, thermobolus et microphones pour enregistrer les symptômes respiratoires. Pour chaque type de données, nous avons collecté 224 échantillons. Les données histologiques et phytopathologiques issues des nécropsies seront également intégrées pour fournir une compréhension complète des mécanismes sous-jacents. Nous utiliserons diverses méthodes statistiques pour intégrer et analyser ces données et comprendre comment la composition et la fonction du microbiote, en combinaison avec le profil glycomique des mucines et la physiopathologie de l'hôte, jouent un rôle dans la prévention et le contrôle des infections pathogènes. L'objectif final est de trouver une combinaison de bactéries ou de glycanes qui pourrait jouer un rôle en tant que probiotiques et prébiotiques.
Ensuite, un temps d'échange sera proposé avec les membres de la plateforme.