Training archives
Each year, the platform offers its "Bioinformatics by practicing" cycle. This cycle covers a broad spectrum of bioinformatics subjects. All modules include both introduction on concepts and skills and practical activities.
Here are the latest training cycles that we have delivered on the platform. (some modules have been delivered a second time)
2023
2022
2021
2020
2019
Initiation au langage R (Module 12)Modélisation in silico de strucures 3D de protéines. Prédiction de fixation de ligands et analyse. Prédiction de mutations. (Module 19)
Initiation à l'utilisation de Galaxy (Module 17)
Python (Module 14)
Perl (Module 11)
Traitement bioinformatique et analyse différentielle de données d'expression RNA-seq sous Galaxy (Module 23)
Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy (Module 8bis)
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)
Initiation à l'inférence phylogénétique (Module 13)
Détection et analyse de variants génomiques (Module 22)
Annotation automatique de génomes bactériens (Module 9)
Analyse statistique de données RNA-Seq -Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio)-
2nd session
Initiation au langage R (Module 12)in silico de strucures 3D de protéines. Prédiction de fixation de ligands et analyse. Prédiction de mutations. (Module 19)
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)
2018
Initiation au langage R (Module 12)Initiation à Perl (Module 11) --- cancelled
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)
Modélisation in silico de strucures 3D de protéines. Prédiction de fixation de ligands et analyse. Prédiction de mutations. (Module 19)
Initiation à Python (Module 14)
Initiation à l'inférence phylogénétique (Module 13) --- cancelled
Initiation à l'utilisation de Galaxy (Module 17)
Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy (Module 8bis)
Traitement bioinformatique des données RNA-Seq sous Galaxy (Module 18bis)
Détection et analyse de variants génomiques (Module 22)
Python avancé (Module 14bis) --- cancelled
Traitement bioinformatique et analyse différentielle de données d'expression RNA-seq sous Galaxy (Module 23)
Perl (Module 11bis) --- cancelled
Annotation automatique de génomes bactériens (Module 9) --- cancelled
Annotation "experte" de génomes bactériens (Module 9bis) --- cancelled
2nd session
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)
2017
Initiation au langage R (Module 12)Modélisation in silico de strucures 3D de protéines. Prédiction de fixation de ligands et analyse. Prédiction de mutations. (Module 19)
Initiation à l'utilisation de Galaxy (Module 17)
Initiation à Python Python (Module 14)
Python avancé (Module 14bis)
Initiation à Perl (Module 11) --- cancelled
Perl avancé (Module 11bis) --- cancelled
Analyse statistique de données RNA-Seq-Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio et Galaxy)- (Module 16)
Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy (Module 8bis)
Traitement bioinformatique des donnéesRNA-Seq sous Galaxy (Module 18bis)
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)
Annotation formelle pour la fouille de texte (Module 15)
Traitement bioinformatique des donnéesRNA-Seq (Module 21)
Annotation des génomes microbiens (Module 9)
2nd session
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)2016
Initiation au langage R (Module 12)Modélisation in silico de strucures 3D de protéines. Prédiction de fixation de ligands et analyse. Prédiction de mutations. (Module 19)
Initiation à l'utilisation de Galaxy (Module 17)
Initiation à Linux (Module 1)
Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy (Module 8bis)
NGS (Module 8) --- cancelled
Traitement bioinformatique des donnéesRNA-Seq sous Galaxy (Module 18bis)
Traitement bioinformatique des donnéesRNA-Seq (Module 18) --- cancelled
Initiation à Python (Module 14)
Python avancé(Module 14bis)
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)
Initiation à Perl (Module 11)
Perl avancé (Module 11bis)
Analyse statistique de données RNA-Seqsous Galaxy -Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées- (Module 16)
Annotation automatique de génomes bactériens (Module 9)
2nd session
Initiation au langage R (Module 12)
Analyse de données métagénomiques 16S (Module 20)
Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy (Module 8bis)
Initiation à l'utilisation de Galaxy (Module 17)
Initiation à Linux (Module 1)
2015
Initiation à Linux (Module 1)Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération (Module 8)
Comparaison de séquences protéiques, recherche d’homologues dans les banques. Application à l’analyse fonctionnelle : attribution d’une fonction aux produits des gènes. (Module 2) --- cancelled
Initiation à Perl (Module 11)
Perl avancé (Module 11bis)
Annotation des génomes microbiens (Module 9)
Ressources Ensembl : Biomart et serveurs DAS (Module 3) --- cancelled
Initiation au langage R (Module 12)
Initiation à l'utilisation de Galaxy (Module 17)
Initiation à la phylogénétique (Module 13)
Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy (Module 8bis)
Initiation à Python (Module 14)
Python avancé (Module 14bis)
Traitement bioinformatique des donnéesRNA-Seq sous Galaxy (Module 18bis)
Modélisation in silico de strucures 3D de protéines. Prédiction de fixation de ligands et analyse. Prédiction de mutations. (Module 19)
Analyse statistique de données RNA-Seq -Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées- (Module 16)
2nd session
Initiation à l'utilisation de Galaxy (Module 17)
Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy (Module 8bis)
Initiation à Linux (Module 1)
Initiation à Linux (Module 1)